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OPTIZYME™ AarI, Fisher BioReagents™

Marque:  Fisher BioReagents BP8069-1

Code produit. 11944822

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Description

Description

5’...C A C C T G C (N)4 ^...3’
3’...G T G G A C G (N)8 ^...5’

Fourni avec : Tampon OPTIZYME 10X Aarl, ScaI, PasI et oligonucléotide 50X
Conditions pour 100 % d’activité :

  • 1Tampon OPTIZYME X Aarl, ScaI, PasI : 10 mM de bis-tris propane-HCl (pH 6,5 à 37°C), 10 mM de MgCl2, 100 mM de KCI, 0,1 mg/ml de BSA
  • 0,5μM d’oligonucléotide
  • Laissez incuber à 37°C
  • Activité enzymatique dans les tampons OPTIZYME :
    • Tampon 1 : Aucune réaction (+oligonucléotide)
  • Tampon 2 : Aucune réaction (+oligonucléotide)
  • Tampon 3 : 0 - 20 % (+oligonucléotide)
  • Tampon 4 : Aucune réaction (+oligonucléotide)
  • Tampon 5 : 0 - 20 % (+oligonucléotide)
  • Tampon de stockage :
    • 10mM de phosphate de potassium(pH 7,4 à 25°C), 100 mM de KCl, 1 mM d’EDTA, 1 mM de DTT, 0,2 mg/ml de BSA et 50 % (v/v) de glycérol.
  • Ligature et nouveau clivage :
  • Plus de 95 % des fragments d’ADN peuvent être ligaturés et recoupés après une surdigestion 10 fois plus importante avec AarI.
  • Digestion de l’ADN incorporé à l’agarose :
  • Un minimum de 5 unités d’AarI est requis pour une digestion complète de 1 μg d’ADN lambda incorporé à l’agarose en 16 heures.
  • Remarques :
    • Au moins deux copies de sa séquence de reconnaissance sont nécessaires pour le clivage avec AarI
    • 0,5 μM d’oligonucléotide améliore le clivage des ADN, en particulier ceux qui ont un seul site AarI.
    • Une surdigestion avec Aarl supérieure à 10 fois peut induire une activité Star.
    • AarI peut rester associée à l’ADN clivé. Cela peut provoquer un décalage de la bande d’ADN pendant l’électrophorèse. Pour éviter de voir des bandes d’ADN atypiques, utiliser le colorant de charge d’ADN 6X et une solution SDS pour la préparation des échantillons, ou chauffer l’ADN digéré en présence de SDS avant l’électrophorèse.

    Effets de méthylation :
    Dam : Ne se chevauche jamais - aucun effet
    Dcm : Ne se chevauche jamais - aucun effet
    CpG : Risque de chevauchement - altération du clivage
    • 5’...CACCTGm5C G...3’
  • 3’...GTGGAC Gm5C...5’
  • (Le clivage est altéré)
  • EcoKI : Ne se chevauche jamais - aucun effet
  • EcoBI : Risque de chevauchement - effet non déterminé

    • TRUSTED_SUSTAINABILITY
    Spécification

    Spécification

    2 U / μl
    37°C
    > 95 % des fragments d’ADN peuvent être ligaturés et recoupés après une digestion excessive multipliée par 10 avec Aarl
    Garder le récipient hermétiquement fermé
    CACCTGC
    Liquide
    25 à 50 % d’eau, > 50 % de glycérine
    7.4
    10mM Potassium Phosphate (pH 7.4 at 25°C), 100mM KCl, 1mM EDTA, 1mM DTT, 0.2mg/mL BSA, 50% Glycerol
    125 U
    Aarl
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    Sécurité et traitement

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    Identifiant produit
    • OPTIZYME

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