Ambion™ Mélange ERCC ARN Spike-In

Description

La variation des données d’expression de l’ARN peut être attribuée à plusieurs facteurs, notamment la qualité du produit de départ, le niveau de cellularité et le rendement en ARN, ainsi que la plateforme utilisée et la personne chargée de mener l’expérience. Pour contrôler ces sources de variabilité, un ensemble commun de contrôles externes d’ARN a été élaboré par le consortium de contrôles externes d’ARN (ERCC), un groupe ad-hoc d’organisations académiques, privées et publiques sous l’égide du National Institute of Standards and Technology (NIST). Ces contrôles sont composés d’un ensemble de transcripts non marqués et polyadénylés, à ajouter aux analyses d’ARN après l’isolement d’échantillons en vue d’effectuer des mesures par rapport aux critères de performance définis. Avant la conception de ces contrôles universellement acceptés, une enquête approfondie des matrices de performance analytique de base était difficilement réalisable. Issus de la marque connue des réactifs d’ARN de qualité, les mélanges de contrôle Ambion™ ERCC Spike-In sont des mélanges commercialisés et pré-formulés de 92 transcripts, dérivés et traçables à partir des plasmides d’ADN certifiés par NIST. Les transcripts ont une longueur de 250 à 2,000 nt, ce qui imite les ARNm eucaryotes naturels.

Caractéristiques du produit principales :

Obtenez une mesure standard pour comparer les données entre diverses expériences d’expression génétique

Mesurez la sensibilité (limite inférieure de détection) et l’échelle dynamique d’une expérience

Quantifiez l’expression génétique différentielle

Libérer le potentiel de l’analyse d’ARN
L’analyse d’ARN, notamment le profilage d’expression génétique et les études de transcriptome, peut améliorer la compréhension des modèles d’expression dans diverses pathologies et approfondir les connaissances sur les voies biologiques et les mécanismes moléculaires qui régulent le devenir des cellules, leur développement et la progression des maladies. Les méthodes traditionnelles de l’analyse d’ARN, comme la qRT-PCR et les microréseaux, sont bien établies mais remplacées par le séquençage de nouvelle génération, une alternative numérique à haut débit. Étant donné que chaque méthode comporte plusieurs plateformes et face à la nécessité de comparer plusieurs échantillons sur des plateformes dans le monde entier, une mesure standard s’impose pour comparer les données. Face aux progrès d’analyse d’ARN, la nécessité de créer une vue standardisée des données sera d’autant plus importante.

Acquérir et comparer les résultats avec une précision confirmée
Les contrôles Spike-In d’ARN Ambion™ ERCC permettent de créer une mesure fondamentale standard d’ARN, que ce soit dans une ou plusieurs expériences avec plusieurs échantillons et plateformes. Grâce aux deux formulations de mélange spike-in (figure 1), plusieurs mesures, comme la sensibilité ou l’échelle dynamique, peuvent être examinées pour accéder à divers paramètres dans une ou plusieurs expériences (figure 2). Qui plus est, vous pouvez calculer les taux d’accroissement-changement de l’expression entre deux échantillons en toute confiance en vous rapportant à la relation hautement concordante entre le mélange ExFold RNA Spike-In 1 et le mélange ExFold RNA Spike-In 2 (figure 3). Les mesures sont déterminées par des concentrations molaires connues pour chaque transcript dans un mélange spike-in et par l’association de deux mélanges en utilisant une combinaison de taux sur 4 sous-groupes des 92 transcripts. Les contrôles conviennent parfaitement aux expériences de séquençage de nouvelle génération, comme le système SOLiD™, et aux plateformes compatibles de microréseaux, comme Illumina™ Sentrix™ BeadChip.

Choisir des options flexibles pour les configurations du kit ERCC
Pour mesurer l’accroissement-le changement de l’échelle dynamique ou de l’expression génétique, les mélanges de contrôle Ambion™ ERCC Spike-In sont disponibles dans deux configurations de kit pour satisfaire vos besoins d’expérimentation. Utilisez le mélange ERCC Spike-In pour déterminer l’échelle dynamique et la limite inférieure de détection sur votre plateforme. Utilisez aussi les mélanges ERCC ExFold Spike-In pour évaluer la précision des mesures d’expression génétique différentielle.

	Mélange ERCC ARN Spike-In 1*	Mélange ExFold Spike-In 1*	Mélange ExFold Spike-In 2*	Eau exempte de nucléase
Mélange ERCC ARN Spike-In (No de catalogue 4456740)	10μL	—	—	1,75 ml
Mélanges ERCC ExFold ARN Spike-In (No de catalogue 4456739)	—	10μL	10μL	1,75 ml

* Bien que les mélanges ERCC RNA Spike-In 1 et ExFold Spike-In 1 contiennent la même formulation des transcripts ERCC, ne substituez pas le mélange ERCC ARN Spike-In 1 au mélange ExFold Spike-In 1 pour évaluer le changement de pli. Utilisez uniquement les mélanges ExFold Spike-In 1 et 2 dotés du même numéro de lot du fabricant.

Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.