Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Software v1.4

Description

Différentes protéines auront des profils Protein Thermal Shift™ différents, chacun avec une forme de courbe de fusion des protéines, une pente, un rapport signal-bruit et une plage de températures de fusion uniques (voir la figure à droite en exemple). Le logiciel Protein Thermal Shift™ génère une ou plusieurs valeurs de température de fusion (Tf) à partir de ces courbes, par le biais de deux méthodes : la Tf dérivée de Boltzmann et la Tf déterminée par la courbe dérivée, pour servir de points de comparaison entre les courbes et pour représenter la stabilité thermique relative de la protéine dans différentes conditions de test.

Deux méthodes pour générer la valeur Tf
La méthode Boltzmann convient aux données d’une région de fusion identifiée automatiquement (ou manuellement) au modèle à deux états de Boltzmann pour générer la Tf. Généralement, pour les protéines ayant un seul domaine de fusion, la méthode Boltzmann est utilisée. Cependant, pour les protéines ayant plusieurs domaines de fusion, la méthode de courbe dérivée peut être utilisée. La méthode de courbe dérivée utilise un second dérivé des données brutes calculé numériquement pour estimer les températures où jusqu’à six pics (maxima locaux) peuvent se produire dans le profil dérivé. Le seuil du rapport signal-bruit, dérivé de manière empirique, est utilisé pour déterminer quelles maxima locaux seront détectées.

Compatible avec nos systèmes de PCR en temps réel
Le logiciel analytique Protein Thermal Shift™ est compatible avec les fichiers d’exécution générés à partir de ces systèmes de PCR en temps réel : QuantStudioTM 3, 5, 6, 6 Pro, 7, 7 Pro, and 12K Flex, StepOne™, StepOnePlus™, 7500, 7500 Fast, et ViiA™7.

Préparez vos échantillons à l’aide de nos kits Protein Thermal Shift™
Préparez vos échantillons à être analysés avec notre kit de démarrage Protein Thermal Shift™ ou notre kit de coloration Protein Thermal Shift™ (disponible séparément). Ces kits permettent aux utilisateurs d’utiliser un colorant qui se lie aux résidus hydrophobes exposés pour surveiller la stabilité thermique des protéines à l’aide d’un instrument de PCR en temps réel afin d’identifier les conditions de tampon qui stabilisent la protéine d’intérêt ou sélectionner les bibliothèques de ligands pour les composés qui lient la protéine d’intérêt.