Applied Biosystems™ Protein Thermal Shift™ Software v1.4

Description

Le logiciel Protein Thermal Shift™ v1,3 a été développé pour analyser les lectures fluorescentes de la fusion des protéines directement à partir des fichiers d’instruments de PCR en temps réel Applied Biosystems™. Différentes protéines auront des profils Protein Thermal Shift™ différents, chacun avec une forme de courbe de fusion des protéines, une pente, un rapport signal-bruit et une plage de températures de fusion uniques (voir la figure ci-dessous pour un exemple). Le logiciel Protein Thermal Shift™ génère une ou plusieurs valeurs de température de fusion (Tm) à partir de ces courbes selon deux méthodes : la Tm dérivée de Boltzmann et la Tm déterminée par la courbe dérivée, qui servent de points de comparaison entre les courbes et représentent la stabilité thermique relative de la protéine dans différentes conditions de test.

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Deux méthodes pour générer des valeurs Tm
La méthode Boltzmann adapte les données d’une région de fusion identifiée automatiquement (ou manuellement) au modèle Boltzmann à deux états pour générer la Tm. Généralement, pour les protéines ayant un seul domaine de fusion, la méthode Boltzmann est utilisée. Cependant, pour les protéines ayant plusieurs domaines de fusion, la méthode de courbe dérivée peut être utilisée. La méthode de courbe dérivée utilise un second dérivé des données brutes calculé numériquement pour estimer les températures où jusqu’à six pics (maxima locaux) peuvent se produire dans le profil dérivé. Un seuil empirique sur le rapport signal-bruit est utilisé pour déterminer les maxima locaux qui seront détectés.

Compatible avec nos systèmes de PCR en temps réel
Notre logiciel d’analyse Protein Thermal Shift™ est compatible avec les fichiers d’exécution générés à partir de ces systèmes de PCR en temps réel : QuantStudio™ 3, 5, 6, 7, and 12K Flex, StepOne™, StepOnePlus™, 7500, 7500 Fast, et ViiA™7.

Préparez vos échantillons à l’aide de nos kits Protein Thermal Shift™
Préparez vos échantillons pour analyse à l’aide de notre kit de démarrage Protein Thermal Shift™ ou de notre kit de colorant Protein Thermal Shift™ (disponibles séparément). Ces kits permettent aux utilisateurs d’utiliser un colorant qui se lie aux résidus hydrophobes exposés pour surveiller la stabilité thermique des protéines à l’aide d’un instrument de PCR en temps réel afin d’identifier les conditions de tampon qui stabilisent la protéine d’intérêt ou sélectionner les bibliothèques de ligands pour les composés qui lient la protéine d’intérêt.