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Ambion™ Mélanges ERCC ExFold RNA Spike-In
Mélanges ERCC ExFold RNA Spike-In
Marque: Ambion™ 4456739
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Description
Les mélanges ERCC ExFold ARN Spike-In fournissent un ensemble de contrôles d’ARN externes qui permettent d’évaluer les performances d’une variété de plateformes technologiques utilisées pour les expériences d’expression génétique. Ajoutez un mélange Spike-In à chaque échantillon d’ARN et exécutez les échantillons Spike-In Mix sur votre plateforme. Comparez ensuite les données Spike-In Mix aux concentrations et aux rapports Spike-In Mix connus pour évaluer la plage dynamique, la limite inférieure de détection et la réponse de changement de pli de votre plateforme. Un certain nombre de technologies d’expression génétique peuvent bénéficier de l’utilisation des mélanges Spike-In ARN ExFold ERCC, notamment le séquençage de nouvelle génération (NGS), les biopuces et les dosages basés sur la PCR. Les microréseaux doivent contenir des sondes conçues pour interroger les transcrits ERCC afin de bénéficier de l’utilisation des mélanges ERCC ExFold ARN Spike-In. Consultez le fabricant du dosage pour plus de détails. Caractéristiques du produit principales :Pourquoi des contrôles d’ARN externes sont nécessaires
La variation des données d’expression de l’ARN peut être attribuée à plusieurs facteurs, notamment la qualité du produit de départ, le niveau de cellularité et le rendement en ARN, ainsi que la plateforme utilisée et la personne chargée de mener l’expérience. Pour contrôler ces sources de variabilité, un ensemble commun de contrôles externes d’ARN a été élaboré par le consortium de contrôles externes d’ARN (ERCC), un groupe ad-hoc d’organisations académiques, privées et publiques sous l’égide du National Institute of Standards and Technology (NIST). Ces contrôles sont composés d’un ensemble de transcripts non marqués et polyadénylés, à ajouter aux analyses d’ARN après l’isolement d’échantillons en vue d’effectuer des mesures par rapport aux critères de performance définis. Avant la conception de ces contrôles universellement acceptés, une enquête approfondie des matrices de performance analytique de base était difficilement réalisable. Issus de la marque connue des réactifs d’ARN de qualité, les mélanges ERCC ExFold Spike-In sont des mélanges commercialisés et pré-formulés de 92 transcripts, dérivés et traçables à partir des plasmides d’ADN certifiés par NIST. Les transcripts ont une longueur de 250 à 2,000 nt, ce qui imite les ARNm eucaryotes naturels.
Libérer le potentiel de l’analyse d’ARN
L’analyse d’ARN, notamment le profilage d’expression génétique et les études de transcriptome, peut améliorer la compréhension des modèles d’expression dans diverses pathologies et approfondir les connaissances sur les voies biologiques et les mécanismes moléculaires qui régulent le devenir des cellules, leur développement et la progression des maladies. Les méthodes traditionnelles de l’analyse d’ARN, comme la qRT-PCR et les microréseaux, sont bien établies mais remplacées par le séquençage de nouvelle génération, une alternative numérique à haut débit. Étant donné que chaque méthode comporte plusieurs plateformes et face à la nécessité de comparer plusieurs échantillons sur des plateformes dans le monde entier, une mesure standard s’impose pour comparer les données. Face aux progrès d’analyse d’ARN, la nécessité de créer une vue standardisée des données sera d’autant plus importante.
Acquérir et comparer les résultats avec une précision confirmée
Les mélanges Spike-In d’ARN ExFold ERCC permettent de créer une mesure fondamentale standard d’ARN, que ce soit dans une ou plusieurs expériences avec plusieurs échantillons et plateformes. Grâce aux deux formulations de mélange spike-in (voir figure), plusieurs mesures, comme la sensibilité ou l’échelle dynamique, peuvent être examinées pour accéder à divers paramètres dans une ou plusieurs expériences (voir figure). Qui plus est, vous pouvez calculer les taux d’accroissement-changement de l’expression entre deux échantillons en toute confiance en vous rapportant à la relation hautement concordante entre le mélange ExFold RNA Spike-In 1 et le mélange ExFold RNA Spike-In 2 (voir figure). Les mesures sont déterminées par des concentrations molaires connues pour chaque transcript dans un mélange spike-in et par l’association de deux mélanges en utilisant une combinaison de taux sur 4 sous-groupes des 92 transcripts. Les contrôles conviennent parfaitement aux expériences de séquençage de nouvelle génération, comme le système SOLiD™, et aux plateformes compatibles de microréseaux, comme Illumina™ Sentrix™ BeadChip.
Choisir des options flexibles pour les configurations du kit ERCC
Pour mesurer l’accroissement-le changement de l’échelle dynamique ou de l’expression génétique, les mélanges de contrôle ERCC Spike-In sont disponibles dans deux configurations de kit pour satisfaire vos besoins d’expérimentation. Utilisez le mélange ERCC Spike-In pour déterminer l’échelle dynamique et la limite inférieure de détection sur votre plateforme. Utilisez aussi les mélanges ERCC ExFold Spike-In pour évaluer la précision des mesures d’expression génétique différentielle.
| Mélange ERCC ARN Spike-In 1* | Mélange ExFold Spike-In 1* | Mélange ExFold Spike-In 2* | Eau exempte de nucléase | |
| Mélanges ERCC ARN Spike-In (No de catalogue 4456740) | 10μL | — | — | 1,75 ml |
| Mélanges ERCC ExFold ARN Spike-In (No de catalogue 4456739) | — | 10μL | 10μL | 1,75 ml |
* Bien que les mélanges ERCC RNA Spike-In 1 et ExFold Spike-In 1 contiennent la même formulation des transcripts ERCC, ne substituez pas le mélange ERCC ARN Spike-In 1 au mélange ExFold Spike-In 1 pour évaluer le changement de pli. Utilisez uniquement les mélanges ExFold Spike-In 1 et 2 dotés du même numéro de lot du fabricant.
Spécification
| -20°C | |
| 1 kit |
Usage exclusivement réservé à la recherche. Ne pas utiliser pour des procédures de diagnostic.